Section CNU : 65 Laboratoire de rattachement : UMR 5174 Evolution et Diversité Biologique Département : Sciences et Technologie Mots-clés : Molécules bioactives, parasite Varroa destructor, santé abeille, venins fourmis exotiques, peptides antimicrobiens
Maître de Conférences section 65
Habilitation à Diriger les Recherches obtenue le 28 novembre 2013
Qualification PR dans 3 sections :
- Section 65 N°14165135447 (2014-2018)
- Section 68 N° 14168135447 (2014-2018)
- Section 64 N° 16164135447 (2016-2020)
Obtention de la PEDR : campagne 2014 (2014-2018)
Responsabilités scientifiques
Codirectrice Equipe « Venins et Activités Biologiques » EA 4357 (officiellement depuis janvier 2010 et jusqu’au 31 décembre 2016). Effectif de l’équipe (sur la base du dossier déposé à l’AERES) : Deux enseignants chercheurs (1 PR 64ème section, 1 MC 65ème section), un ingénieur d’études, un technicien de recherche et formation, un post doctorant et 2 doctorants.
Rédactions de tous les rapports d’activités intermédiaires et finaux des différents contrats.
Encadrement doctoral et scientifique
M1 : 2 Licences (L1, L2 et L3) : 9 IUT : 1 DUT : 1 BTS Anabiotech : 4
Rayonnement
Biology of Reproduction (2005), Archives of Environmental Contamination and Toxicology (2006), Proteomics (2011), Peptides (2011), Proteomics (2012), Apidologie (2013), Plos ONE (2013), Proteomics (3x en 2013), BMC Genomics (2013), Biochimie (2x 2014), Apidologie (2x 2014), Entomology, Ornithology & Herpetology: Current Research (2014), International Journal of Pest Management (2014), BMC Genomics (2014), Toxicon (2x en 2015), Toxins ((3x en 2015), International Journal of Biotechnology and Molecular Biology Research (2015), BMC Genomics (2x en 2015), Scientic reports (2015), Comparative Biochemistry and Physiology (2015), Journal of Proteomics (2015), Naturwissenschaften (2015), Toxins (2x en 2016), anti-Infective Agents 2017, Journal of Venomous Animals and Toxins including Tropical Diseases (2017), Toxicon (2017), Naturwissenschaften (2017), Entomology, Ornithology & Herpetology : Current Research (2017), Life Sciences (2017), anti-Infective Agents (2017) et Toxicon (2x en 2018).
Participation jurys de thèse et comité de thèse
Organisation de deux journées d’étude sur « les abeilles et l’environnement » en novembre 2016 et en décembre 2017, INU Champollion.
Rayonnement
Membre élu du Conseil National des Universités, section 65 (2011-2015) et (2015-2019)
Diffusion du savoir (vulgarisation)
Brevets publiés : 2
Consultation possible des brevets publiés en 2014 (dépôt en 2012) dans la base de données en ligne : http://bases brevets.inpi.fr/fr/resultats recherche simple/
Articles dans des journaux internationaux à comité de lecture : 15 (dont 6 en premier auteur et 7 en dernier auteur)
(Les noms des doctorants, étudiants ou postdoctorants co-auteurs que j’ai encadrés ou coencadrés sont soulignés et l’impact factor de la revue est moyenné sur les 5 dernières années)
Articles de revues internationales : 1
Vétillard A, Bouzid W. (2016). Ants : a chemical library of anticancer molecules. Biol Aujourdhui. 2016;210(2):119-25. doi:10.1051/jbio/2016021. Review.
Chapitre d’ouvrage : 1
Vétillard A et Bouzid W. (2014). Fourmis : une chimiothèque de nouveaux anticancéreux. Ouvrage Biofutur. Juin, N°355:52-55.
Articles de revues nationales : 2
Conférences internationales (y compris avec actes) : 4 communications et 4 affiches
Conférences autres : 23 communications et 3 affiches (17 conférences invitées)
Affiches
1. Présentation synthétique de l’activité d’enseignement au cours de ma carrière
Parallèlement à mes recherches, j’ai toujours enseigné, durant ma thèse en tant que vacataire d’enseignements (120 h ETD) principalement en physiologie animale sous forme de TD et TP pour des étudiants de niveaux DEUG, licence et maîtrise.
A la fin de ma thèse, j’ai bénéficié durant une année d’un poste d’ATER à mi-temps en biochimie soit un volume de 96h ETD d’enseignement sous forme de TD et de TP.
Pendant mon posdoctorat, j’ai assuré 15h de cours/formations pour les doctorants sur la transgénèse, en lien direct avec les constructions transgéniques que je réalisais dans le cadre de mon activité de recherche.
Depuis mon recrutement à l'INU Champollion d’Albi, après trois ans de postdoctorat en Angleterre, j’ai assuré, au titre de mes qualifications aux fonctions de MC dans 6 sections CNU du domaine biologie, une large palette d’enseignements du TP au cours magistral, et de L1 au Master dans diverses disciplines de la biologie (génétique, biologie cellulaire, biotechnologies, biologie moléculaire, immunologie, biologie du développement, biologie animale et physiologie animale). La petite taille de l’établissement imposait d’effectuer des enseignements dans plusieurs disciplines de la biologie. La préparation de tous ces enseignements en début de carrière, parallèlement à la mise en place de l’équipe de recherche, a exigé quelques années de lourds sacrifices sur le plan personnel.
J’ai chaque année assuré un service complet voire jusqu’à une cinquantaine d’heures supplémentaires, à l’exception de l’année 2009-2010 où j’ai bénéficié d’une décharge de 96 heures pour m’investir fortement dans le processus de reconnaissance de l’équipe de recherche VAcBio par le biais de contrats de recherches et de la redéfinition du projet scientifique présenté à l’AERES.
Mon investissement dans la formation s’est traduit par la mise en place et la responsabilité pédagogique d’UE d’enseignements mais aussi par des prises de responsabilités administratives. Dès ma première année en tant que MCF stagiaire, j’ai ainsi été responsable de la licence de biologie L1 (2007-2008) et de l’année Lotus (remise à niveau) sur cette même période.
Ces responsabilités impliquaient notamment l’élaboration des emplois du temps et donc la gestion parfois compliquée avec des membres d’une équipe pédagogique extérieurs à l’établissement et majoritairement d’université toulousaine, car eu égard à la taille de l’établissement nous n’avons pas toutes les compétences sur site. Dans ce contexte, j’ai d’ailleurs, là encore dès mon arrivée, mis en place une UE d’immunologie en deuxième année de la licence Sciences de la vie, enseignement absent jusqu’alors de l’offre de formation à l’INU Champollion malgré son importance dans une licence de biologie. Je suis responsable pédagogique de cet UE mais également des UE de génétique (L1 et L2) ainsi que de celle de biologie moléculaire en L1.
J’ai participé à l’élaboration de la maquette du parcours BCP de L2 avec un fort souhait d’extension de ce parcours en L3 à Albi. Malheureusement, le besoin de faire appel à des compétences extérieures à l’établissement était trop important et le coût trop élevé pour proposer ce parcours sur le site de Champollion.
J’ai également fortement participé à l’élaboration de la maquette du Master MAP dont j’ai été co- responsable ainsi que de la spécialité « Diagnostic, Environnement et Alimentation » de 2009 à 2013 mais également responsable pédagogique de 9 modules sur cette même période. Ce Master, dont j’ai contribué à la mise en place avec adossement à l’équipe VAcBio, a malheureusement dû fermer à la rentrée 2013 en raison de trop faibles effectifs. Malgré le faible effectif d’étudiants dans cette formation Master, cette prise de responsabilité a été très chronophage car nous n’étions que deux EC locaux à y dispenser des enseignements, l’équipe pédagogique était constituée essentiellement d’intervenants toulousains et Montpelliérains. Cette mission concernant la coresponsabilité de ce Master de 2009 à 2013 est intervenue en parallèle du démarrage et de la reconnaissance de l’équipe d’accueil de recherche VAcbio.
2. Présentation synthétique des enseignements actuels par niveau, par type de formation et par nature
• Licences (actuellement responsabilité pédagogique de 4 UE et prise d’une nouvelle responsabilité de licence cette année 2018
En licence de Sciences de la Vie, je me suis impliquée également par mes responsabilités pédagogiques de plusieurs UE et par la mise en place d’une UE d’immunologie qui ne figurait pas dans l’offre de formation malgré son importance dans une licence de biologie.
J’effectue aujourd’hui une grosse partie de mon volume d’enseignement en génétique au niveau Licence (L1 et L2), ce qui me permet de suivre les étudiants sur les deux années. L’objectif de ces UE est de présenter et faire assimiler aux étudiants les fondements de la génétique formelle, moléculaire et des populations. Ces deux modules comprennent 14h + 16h de cours que je dispense totalement. Un volume important de TD (12h + 8h /groupe soit 52h ETD) permet de favoriser l’intégration des concepts à travers des exercices. J’aurais souhaité une partie pratique réalisée sur un modèle animal (par exemple drosophile) afin d’analyser la ségrégation d’allèles dans la descendance, mais l’enveloppe horaire dont dispose l’établissement ne le permet pas.
Par contre, j’assure également tous les enseignements (CM, TD et TP) de biologie moléculaire pour ces mêmes étudiants, ce qui me permet de proposer des TP à l’interface de la génétique et de la biologie moléculaire, tout en utilisant des techniques de biologie moléculaires (PCR et enzymes de restriction) appliqués au génome bactérien.
Concernant l’immunologie, j’ai mis en place cette UE manquante à l’offre de formation de la licence. L’objectif de l’UE d’immunologie est d’apporter aux étudiants les bases de l’immunologie moléculaire et cellulaire mais aussi d’approfondir des cas plus appliqués tels que l’adaptation à la nature du pathogène et la vaccination ou encore les déficits immunitaires et l’origine génétique. Mes CM et les TDs présentent les concepts fondamentaux de l’immunologie, offrant ainsi aux étudiants de solides bases dans la discipline. Toutes les notions de cours sont illustrées lors des séances de TDs sur la base d’analyse d’expériences scientifiques, permettant de travailler la compréhension des mécanismes de la mise en place de la réponse immunitaire innée mais aussi comment l’activation des cellules de l’immunité innée conduit à la mise en place de la réponse adaptative.
J’assure également la partie introductive concernant l’organisation de la cellule eucaryote en biologie cellulaire (L1) ainsi que les TDs et TPs correspondants à ces notions.
J’interviens beaucoup en L1, pour un effectif relativement important qui avoisine les 120 étudiants, avec 3 contrôles continus imposés sur le semestre par UE, le volume horaire consacré aux corrections de copies est loin d’être négligeable.
J’ai assuré et je participe par ailleurs à la correction des rapports et aux soutenances orales de l’UE DICE, ou encore, certaines années, au suivi des stages, correction des rapports et soutenances en L2.
Par ailleurs, j’accueille au laboratoire de nombreux étudiants en stage de « découverte de la recherche » et participe aux jurys de licences depuis 2007.
Cette année 2018, je prends la responsabilité de la Licence professionnelle Génie des Procédés pour l’Environnement dans laquelle je dispenserai dès la rentrée 2018 des heures d’enseignements concernant la bio-remédiation des sols pollués faisant appel aux Outils de la Biologie Moléculaire (OBMs). Mes connaissances seront également mobilisées lors de l’encadrement et le suivi des étudiants dans leurs projets tuteurés et leurs stages.
Cette nouvelle responsabilité nécessitera un investissement relativement important à l’interface entre les partenaires professionnels et l’articulation avec la recherche.
• Masters (mise en place de nouveaux enseignements)
Depuis deux ans, j’interviens dans le Master spécialité Gestion Sociale de l’Environnement sur le Campus d’Albi. Ce master vise à former des professionnels des opérations d’aménagement de territoires. La formation prépare les étudiants dans des secteurs professionnels à l’interface entre environnement et développement territorial. Dans ce contexte, les Outils de Biologie Moléculaire (OBMs) regroupent un ensemble de techniques de pointes utilisées pour les analyses biologiques d’organismes vivants et la compréhension des mécanismes de la cellule à l’échelle des molécules. Initialement développés et appliqués en laboratoire, ces outils rencontrent aujourd’hui de nombreuses applications dans différents domaines (médecine, génétique humaine, environnement, défense...). Depuis quelques années, ces outils ont été appliqués à différentes problématiques environnementales et sont notamment de plus en plus souvent intégrés aux plans de gestions de sites pollués. Leur apport positif et leur succès grandissant dans ce domaine tient au fait que ces outils fournissent des informations complémentaires et souvent uniques permettant d’optimiser les stratégies de remédiation en améliorant l’efficacité des traitements de remédiation et/ou en diminuant la durée et le coût des traitements. Leur intégration aux plans de gestion, en complément des outils conventionnels (données physico-chimiques, hydrogéologiques ou historiques) reste cependant encore limitée.
Mon objectif à travers cet enseignement, dans le cadre de cette formation, n’est pas de former des biologistes moléculaires mais de pallier la méconnaissance de l’existence de ces outils, d’informer les étudiants sur leur valeur ajoutée et leur utilisation à travers des exemples de cas. Un effort de communication, ainsi qu’une meilleure connaissance de ces outils et de leurs applications permettra d’identifier les questions auxquelles il est désormais possible de répondre et in fine d’intégrer de nouveaux paramètres pour optimiser la gestion des sites pollués.
Depuis plusieurs années, mon service d’enseignement représente environ 250h/an. Sur l’année 2016/2017 par exemple, j’ai effectué 251,5 HTD.
Direction, animation, montage de formations
Diffusion
Responsabilités et mandats (internationaux, nationaux)
Membre élu du Conseil National des Universités, section 65 (2011-2015) et (2015-2019)
Responsabilités et mandats locaux ou régionaux :
Responsabilités administratives
Codirectrice Equipe « Venins et Activités Biologiques » EA 4357 (officiellement depuis janvier 2010 et jusqu’au 31 décembre 2016).
Effectif de l’équipe (sur la base du dossier déposé à l’AERES à l’époque) : Deux enseignants chercheurs (1 PR 64ème section, 1 MC 65ème section), un ingénieur d’études, un technicien de recherche et formation, un post doctorant et 2 doctorants